Filtersystem för vacuumfiltrering kan köpas som kompletta system för minimerad kontamineringsrisk eller som separata flaskor och filtertoppar. PES filter används för sin låga proteininbindning och höga flödeshastighet. Sartolab från Sartorius finns i volymer från 50mL upptill 1L och i 3 olika porstorlekar. TPP har system för volymer från 150mL till 1L och i kvadratisk form för att ge 20% högre flödeshastighet än motsvarande runda system.